More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1992 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0324  hypothetical protein  59.7 
 
 		 792 aa  1026    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1509  Transketolase domain protein  58.43 
 
 		 807 aa  976    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277218  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10513  (pyruvate) Oxoisovalerate Dehydrogenase Alpha and Beta Fusion  54.18 
 
 		 801 aa  924    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1648  Transketolase domain protein  55.43 
 
 		 799 aa  910    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2105  Transketolase domain protein  53.11 
 
 		 781 aa  890    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1992  transketolase  100 
 
 		 802 aa  1679    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4914  Transketolase domain protein  60.15 
 
 		 801 aa  1010    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3632  Transketolase domain protein  56.36 
 
 		 804 aa  977    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4512  transketolase domain-containing protein  54.56 
 
 		 804 aa  930    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  27.62 
 
 		 736 aa  258  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  27.34 
 
 		 678 aa  210  9e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  34.65 
 
 		 332 aa  184  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  32.82 
 
 		 327 aa  174  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  32.82 
 
 		 327 aa  174  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  34.04 
 
 		 330 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  33.12 
 
 		 324 aa  167  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  35.69 
 
 		 327 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1077  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  35.37 
 
 		 327 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  30.67 
 
 		 327 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.85 
 
 		 325 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.95 
 
 		 341 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.69 
 
 		 328 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.85 
 
 		 325 aa  164  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  31.85 
 
 		 325 aa  164  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.85 
 
 		 325 aa  164  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.85 
 
 		 325 aa  164  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.85 
 
 		 325 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  31.85 
 
 		 325 aa  164  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.85 
 
 		 325 aa  164  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  31.85 
 
 		 325 aa  164  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  34.9 
 
 		 327 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.21 
 
 		 325 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  30.49 
 
 		 331 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  33.98 
 
 		 325 aa  162  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  32.32 
 
 		 328 aa  161  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  32.42 
 
 		 327 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  36.29 
 
 		 324 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  31.93 
 
 		 331 aa  160  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  30.25 
 
 		 324 aa  160  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  35.56 
 
 		 327 aa  160  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  33.45 
 
 		 327 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  35.56 
 
 		 327 aa  160  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  31.21 
 
 		 325 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  26.03 
 
 		 693 aa  160  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  33.11 
 
 		 327 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  33.44 
 
 		 327 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  36.79 
 
 		 340 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  36.11 
 
 		 325 aa  158  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  32.48 
 
 		 325 aa  158  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  32.37 
 
 		 322 aa  158  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  29.66 
 
 		 325 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  31.73 
 
 		 324 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  35.9 
 
 		 336 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  34.69 
 
 		 324 aa  157  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  31.73 
 
 		 324 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  35.77 
 
 		 325 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  30.42 
 
 		 325 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  32.77 
 
 		 327 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  35.76 
 
 		 325 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  35.76 
 
 		 325 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  35.76 
 
 		 325 aa  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  33.1 
 
 		 326 aa  157  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  32.17 
 
 		 325 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  31.68 
 
 		 348 aa  156  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  32.48 
 
 		 320 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  32.44 
 
 		 327 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  35.96 
 
 		 325 aa  156  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  31.51 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  31.51 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  32.21 
 
 		 338 aa  156  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09511  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  33.45 
 
 		 329 aa  155  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  36.3 
 
 		 325 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  36.3 
 
 		 325 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  36.3 
 
 		 325 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  36.3 
 
 		 325 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  35.96 
 
 		 325 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  35.16 
 
 		 337 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  31.65 
 
 		 325 aa  154  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  31.65 
 
 		 325 aa  154  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  33.65 
 
 		 326 aa  154  8e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  31.29 
 
 		 327 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  29.88 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  33.11 
 
 		 329 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  32.32 
 
 		 337 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  30.06 
 
 		 326 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1452  transketolase, central region  32 
 
 		 352 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10131  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  30.72 
 
 		 327 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453962  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  35.16 
 
 		 337 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  30.86 
 
 		 345 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  25.04 
 
 		 823 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  32 
 
 		 339 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  31.29 
 
 		 335 aa  152  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  31.6 
 
 		 326 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1190  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  31.76 
 
 		 327 aa  152  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  32.09 
 
 		 327 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  30.56 
 
 		 341 aa  152  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  32.86 
 
 		 657 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3963  transketolase central region  32 
 
 		 352 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  29.3 
 
 		 320 aa  151  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  35.84 
 
 		 325 aa  151  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>