49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0182 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  47.16 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  39.1 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  33.89 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  32.02 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  27.22 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  30.07 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  27.33 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  26.49 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  30.6 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0927  hypothetical protein  25.32 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.119484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  30.57 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  30.17 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  27.03 
 
 		 465 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  27.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  28.12 
 
 		 590 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  23.75 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0120  hypothetical protein  23.26 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  22.3 
 
 		 391 aa  47.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  19.75 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  27.91 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.58 
 
 		 619 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1809  hypothetical protein  27.88 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.11 
 
 		 449 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  21.37 
 
 		 596 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  27.89 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.03 
 
 		 613 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  35 
 
 		 643 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  30.65 
 
 		 650 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.81 
 
 		 619 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  19.85 
 
 		 536 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1583  hypothetical protein  28.28 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.81 
 
 		 583 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.19 
 
 		 583 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  21.09 
 
 		 592 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 		 199 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.49 
 
 		 610 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  23.65 
 
 		 421 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  21.53 
 
 		 349 aa  42  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  23.9 
 
 		 529 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.83 
 
 		 613 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  29.03 
 
 		 703 aa  42  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  22.36 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  24.29 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  25 
 
 		 619 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  29.09 
 
 		 675 aa  41.2  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.83 
 
 		 613 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  24.79 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>