28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1002 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
425 aa  858    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  38.53 
 
 
387 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  26.47 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  29.22 
 
 
400 aa  92.8  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  31.84 
 
 
492 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  36.71 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  32.56 
 
 
535 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  29.29 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  28.5 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  30.86 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  26.98 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  30.46 
 
 
614 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  31.58 
 
 
275 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  30.99 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  27.09 
 
 
613 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.69 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20974 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.32 
 
 
464 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.93 
 
 
499 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  26.21 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  27.54 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  29.29 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  29.34 
 
 
514 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  25.73 
 
 
457 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 
370 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.446104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00383  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  28.26 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.965363  normal  0.606284 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.77 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  25.93 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>