44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0398 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0398  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.688788  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.91 
 
 
285 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1734  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.264913  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  24.12 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  22.75 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1128  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  23.94 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  22.66 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  24.61 
 
 
306 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  22.84 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  20.43 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  22.35 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  22.44 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0159  hypothetical protein  23.94 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0236775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  25.2 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  23.32 
 
 
303 aa  48.9  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  25.24 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  24.71 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  24.31 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  24.51 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  21.59 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  24.03 
 
 
303 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  21.55 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  23.83 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  25.58 
 
 
314 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  29.01 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  21.94 
 
 
308 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.84 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  33.68 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  25.71 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  25.19 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  25.19 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1554  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  24.41 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  23.02 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  24.09 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0564  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000354335 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  25.55 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  26.06 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  25.36 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  25.47 
 
 
304 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>