73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0212 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  157  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.19 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  31.58 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  37.7 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  34.48 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.51 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.48 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 153 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 149 aa  40  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>