More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1681 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  71.76 
 
 		 751 aa  1011    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  61.42 
 
 		 727 aa  819    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  59.85 
 
 		 716 aa  772    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  71.62 
 
 		 716 aa  979    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 732 aa  1464    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  45.94 
 
 		 721 aa  615  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  48.14 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  47.49 
 
 		 708 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 		 719 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 		 715 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 688 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 709 aa  392  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 		 679 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 		 689 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  38.09 
 
 		 681 aa  324  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 686 aa  307  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 692 aa  304  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 		 712 aa  259  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 698 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 698 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 722 aa  236  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.87 
 
 		 699 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.62 
 
 		 699 aa  178  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  33.24 
 
 		 408 aa  150  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.49 
 
 		 386 aa  120  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 395 aa  109  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.57 
 
 		 609 aa  100  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.39 
 
 		 609 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.26 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  24.26 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  24.26 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.26 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.56 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.26 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  24.05 
 
 		 609 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 		 609 aa  97.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.65 
 
 		 609 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 530 aa  95.1  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 		 387 aa  90.5  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 		 389 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 389 aa  87.4  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 756 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  24.71 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  25.08 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.62 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.62 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.56 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.62 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.62 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.3 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.62 
 
 		 387 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.62 
 
 		 387 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.62 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.32 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  23.77 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.32 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.53 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  23.44 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.32 
 
 		 387 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  29.74 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.08 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  25.47 
 
 		 609 aa  70.5  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.23 
 
 		 587 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 656 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 		 566 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  23.89 
 
 		 586 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.86 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.91 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  24.05 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  22.61 
 
 		 775 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  21.07 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.52 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  23.25 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  23.57 
 
 		 586 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 385 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  23.03 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  25.41 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  23.36 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  27.73 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>