More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1432 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1432  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  100 
 
 
465 aa  897    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1737  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  51.98 
 
 
462 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1551  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  51.98 
 
 
462 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0733202  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1917  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  52.2 
 
 
462 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.787882  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1516  NADH dehydrogenase subunit N  36.63 
 
 
496 aa  279  6e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.858529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0194  NADH dehydrogenase subunit N  38.5 
 
 
486 aa  276  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1669  NADH dehydrogenase subunit N  37.34 
 
 
496 aa  265  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1815  NADH dehydrogenase subunit N  36.96 
 
 
502 aa  262  8.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000937522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.44 
 
 
494 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000123394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.35 
 
 
487 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.17 
 
 
484 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.96 
 
 
484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.21 
 
 
492 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.66 
 
 
489 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.53 
 
 
484 aa  176  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  29.44 
 
 
490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  29.74 
 
 
490 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  29.7 
 
 
497 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  30.69 
 
 
478 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.61 
 
 
487 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.87 
 
 
457 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  28.22 
 
 
482 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  28.11 
 
 
482 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  27.74 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.16 
 
 
489 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  28.33 
 
 
497 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  30.42 
 
 
485 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  27.59 
 
 
494 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  27.2 
 
 
497 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.89 
 
 
479 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  30.05 
 
 
489 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.21 
 
 
483 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29 
 
 
498 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  30.34 
 
 
485 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  30.34 
 
 
485 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  30.34 
 
 
485 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.67 
 
 
491 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  30.34 
 
 
490 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  30.34 
 
 
490 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  30.34 
 
 
490 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  29.27 
 
 
491 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  30.34 
 
 
490 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.67 
 
 
491 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.67 
 
 
491 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.12 
 
 
496 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  29.48 
 
 
481 aa  159  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  28.75 
 
 
488 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  28.68 
 
 
488 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  28.75 
 
 
488 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  28.26 
 
 
488 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  28.75 
 
 
488 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1506  NADH dehydrogenase subunit N  28.57 
 
 
495 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.523912  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.57 
 
 
506 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.50446  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.69 
 
 
513 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.54 
 
 
479 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.52 
 
 
511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0714  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.68 
 
 
503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.760446  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  29.73 
 
 
492 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  28.84 
 
 
519 aa  156  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.8 
 
 
516 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.22 
 
 
482 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.45 
 
 
511 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  29.74 
 
 
479 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  27.43 
 
 
478 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  26.76 
 
 
511 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.94 
 
 
511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  29.61 
 
 
487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.31 
 
 
488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  29.18 
 
 
533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.45 
 
 
491 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  28.4 
 
 
493 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.33 
 
 
476 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  28.3 
 
 
479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.12 
 
 
511 aa  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  32.02 
 
 
485 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.87 
 
 
498 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  29.76 
 
 
485 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.4 
 
 
500 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  29.76 
 
 
485 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5539  NADH dehydrogenase subunit N  30 
 
 
506 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.758308  normal  0.475403 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  29.76 
 
 
485 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  29.76 
 
 
485 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  27.2 
 
 
476 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  29.76 
 
 
485 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0755  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.06 
 
 
493 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  29.25 
 
 
487 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  26.94 
 
 
511 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0764  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.43 
 
 
464 aa  151  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1605  NADH dehydrogenase (quinone)  28.11 
 
 
475 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  28.1 
 
 
478 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  28.1 
 
 
478 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3809  NADH dehydrogenase subunit N  30.04 
 
 
506 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  27.6 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  28.68 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  27.59 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  26.72 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  25.75 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000633483  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  28.63 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5411  NADH dehydrogenase subunit N  29.38 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4154  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.64 
 
 
489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0272141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>