33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0466 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  59.23 
 
 		 227 aa  251  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  57.69 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  37.45 
 
 		 227 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  35.04 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  31.36 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  28.85 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  35.96 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  34.74 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  27.12 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  26.56 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  34.29 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  26.47 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  26.47 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  26.88 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  28.57 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  25 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  38.78 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  22.29 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  27.59 
 
 		 268 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  32.22 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.19 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  36.54 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  24.31 
 
 		 290 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  28.85 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  21.71 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  29.51 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  28.4 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  25.14 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  34.52 
 
 		 274 aa  41.6  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  31.82 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  24.09 
 
 		 281 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>