More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2942 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  100 
 
 
480 aa  933    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  72.05 
 
 
482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  66.01 
 
 
478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  67.1 
 
 
476 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  62.58 
 
 
487 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  60.04 
 
 
448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  54.99 
 
 
470 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  54.15 
 
 
472 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  59.35 
 
 
445 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  58.98 
 
 
439 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  53.63 
 
 
518 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  53.88 
 
 
429 aa  415  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  51.12 
 
 
484 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  52.12 
 
 
452 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  54.69 
 
 
449 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  50.57 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  51.7 
 
 
433 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  49.76 
 
 
457 aa  328  9e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  50.63 
 
 
414 aa  302  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  49.23 
 
 
414 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  37.12 
 
 
452 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  33.1 
 
 
442 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  34.64 
 
 
470 aa  225  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  29.23 
 
 
428 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  29.7 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.37 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  35.29 
 
 
403 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  31.59 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  33.49 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.74 
 
 
415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.13 
 
 
409 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  35.37 
 
 
404 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.15 
 
 
415 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.36 
 
 
414 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  36.73 
 
 
404 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.37 
 
 
415 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.41 
 
 
408 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.51 
 
 
413 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  33.93 
 
 
413 aa  207  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  33.68 
 
 
404 aa  206  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.48 
 
 
417 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.65 
 
 
414 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  36.52 
 
 
410 aa  206  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.31 
 
 
406 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.4 
 
 
414 aa  203  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.47 
 
 
412 aa  203  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.75 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.75 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  37.15 
 
 
896 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  34.14 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.87 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  35.65 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  31.33 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.78 
 
 
425 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 
404 aa  200  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  36.53 
 
 
880 aa  199  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.77 
 
 
412 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.48 
 
 
435 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  35.85 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.07 
 
 
406 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.1 
 
 
605 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.67 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.77 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.91 
 
 
426 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.78 
 
 
413 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.45 
 
 
408 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  32.97 
 
 
420 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  34.78 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  39.67 
 
 
425 aa  196  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  33.18 
 
 
688 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  37.81 
 
 
414 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  39.69 
 
 
422 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.51 
 
 
418 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.51 
 
 
418 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  32.91 
 
 
406 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.91 
 
 
406 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  32.91 
 
 
406 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.91 
 
 
406 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  32.91 
 
 
406 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  33.08 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  33.08 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  33.08 
 
 
406 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.37 
 
 
417 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  34.46 
 
 
422 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  31.93 
 
 
405 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.16 
 
 
451 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.46 
 
 
878 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  31.66 
 
 
405 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  31.91 
 
 
405 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.94 
 
 
885 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.16 
 
 
404 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.9 
 
 
414 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.64 
 
 
414 aa  194  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.7 
 
 
413 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.68 
 
 
412 aa  193  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.13 
 
 
414 aa  193  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.53 
 
 
407 aa  193  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.53 
 
 
650 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.65 
 
 
399 aa  193  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>