More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04120 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04120  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.745463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1170  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.64 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3613  lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  48.62 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.127001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3900  lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  48.62 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0925  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000502161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3809  putative lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  48.62 
 
 		 220 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3009  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.333093 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  39.91 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  39.91 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4752  response regulator  37.67 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1166  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  36.64 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  36.09 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0244  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  36.09 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  35.22 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.51 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  38.29 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  34.53 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  34.08 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  34.08 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  35.71 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 242 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 239 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.84 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  34.96 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 635 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  35.71 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  37.44 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  37.77 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  37.77 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  37.77 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  37.77 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.59 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  34.08 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.62 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>