295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2881 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  749    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  55.22 
 
 
365 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  38.53 
 
 
369 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  39.54 
 
 
367 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  37.09 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  37.09 
 
 
366 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  38.1 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  38.1 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  37.19 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  37.09 
 
 
366 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 
366 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 
378 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 
366 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  37.19 
 
 
366 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  36.64 
 
 
369 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 
366 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 
367 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  38.31 
 
 
362 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  43.48 
 
 
280 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  35.07 
 
 
368 aa  216  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  32.4 
 
 
370 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
364 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 
373 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 
334 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 
360 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  35 
 
 
354 aa  193  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 
364 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  41.01 
 
 
280 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  32.18 
 
 
291 aa  186  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  31.81 
 
 
379 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
290 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.1 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 
360 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.45 
 
 
742 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  28.53 
 
 
356 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.63 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.45 
 
 
314 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 
286 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.62 
 
 
748 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 
286 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.4 
 
 
287 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 
307 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.92 
 
 
312 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.8 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
313 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.68 
 
 
746 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.38 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.97 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  30.6 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.04 
 
 
746 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  30.56 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  31.1 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 
288 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 
299 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.67 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
313 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.62 
 
 
307 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  32.07 
 
 
292 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 
293 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  31.47 
 
 
285 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
297 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  32.51 
 
 
286 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.45 
 
 
311 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.45 
 
 
311 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.04 
 
 
321 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.04 
 
 
321 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.03 
 
 
311 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  32.4 
 
 
535 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.1 
 
 
311 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.18 
 
 
735 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.75 
 
 
746 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 
312 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.71 
 
 
313 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.6 
 
 
311 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.45 
 
 
298 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 
312 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.57 
 
 
746 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.7 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
328 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.77 
 
 
770 aa  156  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 
312 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.94 
 
 
308 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.71 
 
 
752 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.4 
 
 
746 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.45 
 
 
322 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 
534 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  31.29 
 
 
318 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  33.81 
 
 
313 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.69 
 
 
311 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.93 
 
 
313 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.13 
 
 
319 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.5 
 
 
301 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  30.57 
 
 
390 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  26.9 
 
 
328 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>