More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1777 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  100 
 
 
124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  68.03 
 
 
126 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  43.9 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  49.58 
 
 
136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  50 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  46.46 
 
 
131 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  36.07 
 
 
134 aa  84.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  32.79 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  38.53 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  35 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  40.17 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  36.8 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  32.79 
 
 
134 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  31.97 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  32.79 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  35.4 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  33.61 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  36.61 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  34.75 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  30.3 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  34.71 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  34.21 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  33.05 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  32.52 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  32.52 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  32.97 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  30.7 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  32.71 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  30.7 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  31.3 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  28.7 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  32.95 
 
 
704 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  31.9 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  28.97 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  30.19 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  31.36 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  32.77 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  35.11 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  29.82 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  32.69 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  28.18 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.63 
 
 
711 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
699 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  31.48 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1672  CoA-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  31.78 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.19 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  30.19 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  30.19 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  27.37 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  29.46 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  30.53 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  31.43 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  29.91 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  29.46 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  28.12 
 
 
159 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  36.45 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  31.19 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  31.43 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  29.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  29.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  29.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  26.21 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  29.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  29.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  33.01 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  29.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  27.2 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  29.09 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  24.47 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  27.12 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  26.89 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  37.18 
 
 
712 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  30.84 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  30 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  29.51 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  25.96 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  30.95 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  32.22 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  29.36 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  26.55 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.23 
 
 
702 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  30.63 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  32.18 
 
 
695 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  25 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  41.54 
 
 
711 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.89 
 
 
892 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
882 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  33.04 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  32.18 
 
 
695 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  27.52 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>