More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1153 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1153  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.56 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.5 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  38.84 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  39.01 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.77 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  38.74 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  40.54 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  38.33 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  35.96 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  36.12 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  35.93 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  35.93 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 236 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  35.09 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  35.09 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  35.09 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  35.09 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  35.09 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  35.09 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  35.09 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  36.65 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.5 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  40.36 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.11 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  35.5 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  35.11 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  35.11 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>