94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1058 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1058  HI0933 family protein  100 
 
 		 425 aa  879    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1057  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain protein  53.65 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.88 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.72 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  28.42 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  21.41 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  22.46 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  23.27 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  20.82 
 
 		 386 aa  57  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  20.82 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  21.22 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.62 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.14 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  22.66 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  27.37 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  21.72 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1183  oxidoreductase, FAD-binding  24.59 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3301  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.41 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000230546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  24.32 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  24.32 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  41.51 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  28.26 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2854  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.73 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000692604  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  29.66 
 
 		 643 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  24.86 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  22.4 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.09 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2742  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  61.76 
 
 		 493 aa  47.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  0.340256 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  51.35 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0826  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex E3 component  45.83 
 
 		 496 aa  46.6  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  26.19 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  20.95 
 
 		 458 aa  46.6  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  24.61 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4409  monooxygenase, FAD-binding  25.13 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1010  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.6 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  normal  0.0569415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  23.44 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  28.1 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  24.86 
 
 		 578 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  21.58 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  26.37 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  22.32 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.21 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.74 
 
 		 605 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.74 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  30.11 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.74 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.58 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.74 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  26.04 
 
 		 584 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.95 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  24.61 
 
 		 541 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  23.7 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  52.78 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.74 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 		 577 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.47 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  22.11 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.5 
 
 		 572 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.221964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  27.32 
 
 		 503 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.38 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  41.07 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  20.74 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  26.63 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 539 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  27.97 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4096  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  34.15 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  20.35 
 
 		 579 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  24.86 
 
 		 528 aa  43.5  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  60 
 
 		 309 aa  43.5  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  22.4 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0012  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.82 
 
 		 566 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.492266  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.62 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.62 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.12 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  40.91 
 
 		 518 aa  43.1  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.23 
 
 		 465 aa  43.1  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.92 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  48.84 
 
 		 348 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.62 
 
 		 476 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  23.81 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 513 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>