More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5319 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  270  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 229 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 229 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  42.86 
 
 		 241 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  44.54 
 
 		 247 aa  101  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  44.72 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 248 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 235 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  45.38 
 
 		 355 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 228 aa  98.6  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.31 
 
 		 240 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 230 aa  98.6  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 246 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  44.44 
 
 		 248 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 236 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 237 aa  97.8  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 234 aa  97.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.46 
 
 		 242 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 230 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.16 
 
 		 238 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.69 
 
 		 231 aa  96.7  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 243 aa  96.7  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  40 
 
 		 248 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 1609 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.17 
 
 		 767 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 256 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 443 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 242 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  43.33 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 263 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 242 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  40.8 
 
 		 234 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 231 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1904  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 226 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00970528  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2074  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 226 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00164535  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 223 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.18 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 233 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 244 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 231 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  39.02 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 443 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1631 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.73 
 
 		 231 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 243 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 243 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  41.22 
 
 		 221 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1130  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 243 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  41.73 
 
 		 248 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 247 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  94.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  39.29 
 
 		 248 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 248 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.34 
 
 		 589 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  41.09 
 
 		 248 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 248 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.66 
 
 		 308 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.61 
 
 		 1131 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.64 
 
 		 236 aa  94  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 234 aa  94  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 247 aa  93.6  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  41.67 
 
 		 248 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 233 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 231 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 233 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 233 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 230 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 230 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 230 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 235 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 216 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  49.57 
 
 		 236 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 254 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>