More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3963 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  100 
 
 		 168 aa  340  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  58.06 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  50.98 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  49.08 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  46.71 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  47.77 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  48.1 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  48.08 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  46.01 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  48.08 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  48.25 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  43.67 
 
 		 183 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  41.91 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 194 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 228 aa  98.6  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 197 aa  98.2  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  35.17 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  35.25 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2505  response regulator receiver domain-containing protein  34.51 
 
 		 316 aa  88.2  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0661  response regulator receiver protein  31.41 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1841  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  36.07 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  36.07 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  35.77 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  33.61 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  34.43 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  35.77 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  39.68 
 
 		 402 aa  77.8  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  35.43 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  35.43 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  34.43 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.07 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2623  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 123 aa  77  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  36.07 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.28 
 
 		 394 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  42.45 
 
 		 368 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.43 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  31.75 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  36.59 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  36.59 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  32.52 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  33.61 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32.52 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  34.04 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>