36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2431 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  75.47 
 
 
223 aa  339  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  50.94 
 
 
226 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  52.58 
 
 
231 aa  227  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  50.47 
 
 
226 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  51.42 
 
 
226 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  51.18 
 
 
223 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  51.42 
 
 
226 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  50.71 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  49.53 
 
 
217 aa  224  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  48.6 
 
 
224 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  47.47 
 
 
227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  48.58 
 
 
730 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  46.45 
 
 
223 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  48.11 
 
 
218 aa  208  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  48.6 
 
 
221 aa  207  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  50.24 
 
 
217 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  47.14 
 
 
229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  45.91 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.6 
 
 
743 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  44.29 
 
 
222 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  44.24 
 
 
226 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  31.31 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  27.75 
 
 
242 aa  89  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  25.64 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.39 
 
 
650 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  25.63 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.43 
 
 
647 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.7 
 
 
623 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.12 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  28.49 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  22.34 
 
 
227 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  25.97 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  23.03 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  21.18 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  23.81 
 
 
236 aa  42  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>