25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1713 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1713  lycopene cyclase  100 
 
 		 395 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0564818  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3576  lycopene cyclase  51.96 
 
 		 385 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1817  lycopene cyclase  48.42 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3135  lycopene cyclase  44.09 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2209  lycopene cyclase  45.19 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3200  lycopene cyclase  36.6 
 
 		 380 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696424  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02164  hypothetical protein  25.93 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  29.35 
 
 		 374 aa  67  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  24.94 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0926  lycopene beta and epsilon cyclase  19.5 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0447  Lycopene beta and epsilon cyclase  21.15 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3088  putative lycopene cyclase  27.27 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0382  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.57 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2408  lycopene beta and epsilon cyclase  26.35 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  22.86 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  23.05 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  29.41 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  30.83 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  23.84 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  22.95 
 
 		 528 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  28.79 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  22.31 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  22.39 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  31.1 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  29.05 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>