More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1237 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1237  histidine kinase  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0245097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
770 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
844 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  38.13 
 
 
790 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
511 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
798 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  39.83 
 
 
511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
600 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
1138 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
513 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  37.8 
 
 
511 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
511 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
774 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
512 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  36.78 
 
 
771 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
769 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  37.02 
 
 
532 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  36.82 
 
 
513 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  36.67 
 
 
513 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  36.82 
 
 
513 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
523 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
468 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
786 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  36.36 
 
 
771 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
505 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
617 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
795 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
518 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
775 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
769 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  36.36 
 
 
773 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
1276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
797 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
1296 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
531 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  37.34 
 
 
786 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
779 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
530 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
784 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
643 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
786 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
389 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
511 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
772 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
769 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  37.18 
 
 
774 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
530 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
562 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  35.68 
 
 
783 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  35.68 
 
 
783 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
614 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
778 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
775 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  37.8 
 
 
648 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  37.39 
 
 
609 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
646 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
533 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  37.39 
 
 
609 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
911 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  34.18 
 
 
1410 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
782 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
484 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
579 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
764 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
509 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
1192 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
536 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
594 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
1055 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
502 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
793 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
536 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
728 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  31.69 
 
 
1035 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
377 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  34.93 
 
 
470 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  34.21 
 
 
525 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
605 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
587 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
969 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  33.62 
 
 
508 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
717 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  31.28 
 
 
1035 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
606 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
456 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
627 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
582 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
1000 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
661 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
836 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
614 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  37.72 
 
 
938 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
704 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
773 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
494 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
605 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  36.91 
 
 
464 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
568 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  34.33 
 
 
470 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
610 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>