More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0696 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  53.51 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  52.63 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  53.25 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  40.51 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  41.49 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  42.92 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  45.26 
 
 		 251 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  39.57 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  38.72 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  38.72 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  38.56 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  40.34 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  41 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  40.34 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  38.63 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  36.91 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  36.91 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  40.52 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  37.29 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  35.74 
 
 		 242 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  37.02 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  34.89 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  36.17 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  35.32 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  36.4 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  35.22 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  34.91 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 		 236 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  36.1 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  35.19 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.08 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  33.17 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  31.58 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.63 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  31.39 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  33.96 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  35.33 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  29.31 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  29.27 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  31.4 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  31.07 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  31.98 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  32.14 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.81 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  30.99 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  38.24 
 
 		 532 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  31.97 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  30.13 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.57 
 
 		 536 aa  65.9  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  30.99 
 
 		 539 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.1 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  32.19 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  32.09 
 
 		 532 aa  65.1  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  30.4 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  29.7 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  30.36 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  33.33 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  39.39 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  31.88 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  29.3 
 
 		 539 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  30.46 
 
 		 535 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  31.4 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  31.62 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  32.37 
 
 		 541 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.93 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  30.5 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  29.95 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  29.17 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  26.97 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1308  GMP synthase  32.67 
 
 		 539 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00743911  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  32.09 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2764  GMP synthase  30 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727544  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1372  GMP synthase  33.33 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588127  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  34.92 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  26.47 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  34.62 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  33.59 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.7 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  30.3 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  33.85 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  35.92 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  33.86 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>