102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0059 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0059  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00036948  normal  0.453109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4333  tRNA-Phe  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0560491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0014  tRNA-Phe  85.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000072957  hitchhiker  0.009028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0006  tRNA-Phe  85.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0045  tRNA-Phe  85.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0046  tRNA-Phe  85.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.300916  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0005  tRNA-Phe  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0051  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00174909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0023  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163984  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0056  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0039  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000864029  hitchhiker  0.00000418087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000781489  hitchhiker  0.000000692381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0047  tRNA-Phe  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000150278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0207  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0208  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  83.82 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0030  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0867415  normal  0.184559 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t12  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0141221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0073  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000194446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0011  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0022  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.688613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0046  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0017  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0055  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.579844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0738  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0594  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0194  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0056  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102951  normal  0.0568899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102505  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0058  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.0549747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0042  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0849225  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0021  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0053  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35030  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.838574  normal  0.836072 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02500  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0173086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0028  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0001  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0473028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>