299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0080 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0016  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000022275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t60  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA76  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R9  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0001  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236291  normal  0.254475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0063  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5734  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.086829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5830  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0216141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000520141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0037  tRNA-Phe  98.15 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0072  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00159323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0161647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5712  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0145  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5345  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000017112  hitchhiker  0.00000000000596861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4564  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000213721  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0531  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37377e-30 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0013  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0111  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00210524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0084  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000702597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0149  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0145  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000807799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4989  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5573  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26339e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5651  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0084  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0011  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443176  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t03  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104113 
 
 
-
 
NC_006368  lppt29  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt29  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1129  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0063  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0091  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373853 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0999  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0012  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0007  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.026745 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0044  tRNA-Phe  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0059  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0055  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0001  tRNA-Phe  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0053  tRNA-Phe  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000574289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0041  tRNA-Phe  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.837843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0002  tRNA-Phe  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.133114  normal  0.804364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2143  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1750  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>