299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0024 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t60  tRNA-Phe  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA76  tRNA-Phe  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R9  tRNA-Phe  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  95.77 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0002  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna104  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000422121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0001  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236291  normal  0.254475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0002  tRNA-Phe  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0047  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000150278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0091  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0145  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0063  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0002  tRNA-Phe  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0002  tRNA-Phe  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0028  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000645799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0007  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.026745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0012  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0017  tRNA-Phe  98.18 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0017  tRNA-Phe  98.18 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1129  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt29  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt29  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0016  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000022275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0999  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t03  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0004  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.111017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00079  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0052  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0101  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0733  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00229797  decreased coverage  0.0082117 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0161  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129088 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0037  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0083  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3292  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3358  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA8  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3111  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0206196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0016  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0448641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4271  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3610  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3366  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557417  normal  0.506535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4682  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4739  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4591  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.441265  normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0054  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3461  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4717  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4698  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0079  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4603  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000814099  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4281  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0009  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.690958  normal  0.0734418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4722  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00159768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>