299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0002 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  95.77 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0001  tRNA-Phe  94.59 
 
 
76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  98.39 
 
 
76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0005  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0005  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  93.42 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0028  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000645799  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0145  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  94.37 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  94.37 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0011  tRNA-Phe  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443176  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0037  tRNA-Phe  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  94.2 
 
 
76 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  94.2 
 
 
76 bp  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  98.21 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0009  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.690958  normal  0.0734418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0052  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328618  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0054  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA8  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0037  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4333  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0560491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  98.21 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0013  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011671  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0031  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  93.06 
 
 
76 bp  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0019  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0003  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0075  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283393  normal  0.209265 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0039  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0072  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0056  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744402  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0039  tRNA-Phe  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.744114  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  96.55 
 
 
73 bp  99.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0015  tRNA-Phe  95.16 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0002  tRNA-Phe  95.16 
 
 
73 bp  99.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  96.55 
 
 
73 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0040  tRNA-Phe  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000293761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0041  tRNA-Phe  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  92.75 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  96.49 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  95.08 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  92.75 
 
 
78 bp  97.6  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  92.75 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  92.75 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0051  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0006    90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0548782  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  96.43 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0056  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0067  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.687392  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0071  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0756979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0006  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0024  tRNA-Phe  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.117036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0047  tRNA-Phe  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0032  tRNA-Phe  92.42 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna104  tRNA-Phe  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000422121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  93.44 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0056  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>