More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0269 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0015  tRNA-Phe  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  96.55 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  96.49 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4333  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0560491  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  96.23 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4139  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.32664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4150  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0005  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0001  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236291  normal  0.254475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0005  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0047  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000150278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  93.22 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0594  tRNA-Phe  93.1 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0004  tRNA-Phe  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.111017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0039  tRNA-Phe  95.92 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00079  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0014  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0101  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341068  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4591  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.441265  normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3281  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0007  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.026745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3610  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0016  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0448641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3111  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0206196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4603  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000814099  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4739  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653879  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0003  tRNA-Phe  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0037  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0083  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4271  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128449  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R9  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4682  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3358  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4281  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4210  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4599  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0091  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000373853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0012  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16976  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4717  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819491  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5108  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0091  tRNA-Phe  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.704949  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0072  tRNA-Phe  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3366  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557417  normal  0.506535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0161  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0056  tRNA-Phe  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744402  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0733  tRNA-Phe  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00229797  decreased coverage  0.0082117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>