More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0738 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0738  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  97.26 
 
 
73 bp  129  9.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.55 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t12  tRNA-Phe  96.49 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0141221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0017  tRNA-Phe  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0011  tRNA-Phe  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0046  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0022  tRNA-Phe  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.688613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0023  tRNA-Phe  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt23  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0030  tRNA-Phe  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0867415  normal  0.184559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0171  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPhe01  tRNA-Phe  95.92 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  95.92 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0055  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0047  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0086  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  97.62 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0016  tRNA-Phe  97.62 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0193  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0260  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2156  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2770  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0191  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.285642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0250  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1867  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2455  tRNA-Phe  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0046  tRNA-Phe  92.45 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.300916  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0207  tRNA-Phe  97.56 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0039  tRNA-Phe  97.56 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0060  tRNA-Phe  97.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0045  tRNA-Phe  92.45 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0054  tRNA-Phe  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0006  tRNA-Phe  92.45 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0208  tRNA-Phe  97.56 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.394073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  95.45 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  95.45 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  90.91 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0053  tRNA-Phe  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.189641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0055  tRNA-Phe  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.579844  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0051  tRNA-Phe  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0050  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0014  tRNA-Phe  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000072957  hitchhiker  0.009028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0594  tRNA-Phe  89.83 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0053  tRNA-Phe  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0020  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.338  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0022  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.45164  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0036  tRNA-Phe  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000108389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0028  tRNA-Phe  95.24 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1570  tRNA-Phe  88.71 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1596  tRNA-Phe  88.71 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250101  normal  0.561376 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1605  tRNA-Phe  88.71 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0061  tRNA-Phe  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0001  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0473028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  91.84 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4139  tRNA-Phe  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.32664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4150  tRNA-Phe  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0016  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0071  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0026  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.981393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0017  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>