More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0001 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0045  tRNA-Phe  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0006  tRNA-Phe  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0046  tRNA-Phe  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.300916  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0055  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0086  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  98.28 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0053  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.189641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0014  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000072957  hitchhiker  0.009028 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna104  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000422121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5734  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.086829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0072  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00159323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0111  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00210524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000520141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5651  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0055  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.579844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0084  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0161647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0145  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000807799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0149  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4564  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000213721  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0531  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37377e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5345  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000017112  hitchhiker  0.00000000000596861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4989  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0013  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5573  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26339e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0084  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000702597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5830  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0216141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5712  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0145  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0053  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0001  tRNA-Phe  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236291  normal  0.254475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt29  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt29  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1129  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0999  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0001  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0473028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0005  tRNA-Phe  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0063  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>