More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1779 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  100 
 
 
526 aa  1058    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  55.71 
 
 
540 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  54.67 
 
 
574 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  48.92 
 
 
536 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  50.3 
 
 
540 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  46.98 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  52.32 
 
 
528 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  52.22 
 
 
528 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  52.22 
 
 
528 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  52.22 
 
 
528 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  52.22 
 
 
528 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  52.22 
 
 
528 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  52.22 
 
 
528 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  51.16 
 
 
540 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  45.66 
 
 
610 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  49.7 
 
 
533 aa  363  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  49.38 
 
 
543 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  41.58 
 
 
491 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  41.19 
 
 
491 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  43.96 
 
 
488 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  41.67 
 
 
491 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  40.79 
 
 
491 aa  349  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  41.03 
 
 
491 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  41.27 
 
 
491 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  41.27 
 
 
491 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  41.47 
 
 
491 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  41.47 
 
 
491 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  40.71 
 
 
491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  42.07 
 
 
519 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  42.14 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  46.78 
 
 
513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  41.98 
 
 
544 aa  312  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  43.26 
 
 
475 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  41.68 
 
 
505 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  38.23 
 
 
536 aa  299  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  38.1 
 
 
533 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  37.5 
 
 
536 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  37.3 
 
 
536 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  37.38 
 
 
536 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  37.1 
 
 
536 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  37.3 
 
 
536 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  37.3 
 
 
536 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  37.3 
 
 
536 aa  289  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  36.9 
 
 
536 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  43.72 
 
 
468 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  37.94 
 
 
526 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  36.24 
 
 
581 aa  265  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  38.22 
 
 
499 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  36.89 
 
 
530 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  37.45 
 
 
509 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  35.84 
 
 
519 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1458  Amidase  40.09 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.249504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.92 
 
 
475 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.68 
 
 
485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.26 
 
 
491 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.42 
 
 
475 aa  196  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.58 
 
 
489 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.12 
 
 
491 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  36.06 
 
 
559 aa  194  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  35.29 
 
 
566 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.21 
 
 
488 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  33.14 
 
 
506 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  31.77 
 
 
542 aa  190  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1003  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.82 
 
 
484 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.94 
 
 
494 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  33.33 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.26 
 
 
486 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2947  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.52 
 
 
487 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.69 
 
 
1806 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.73 
 
 
482 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  42.75 
 
 
1632 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1951  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.08 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.759727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.34 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.19 
 
 
488 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0945  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.68 
 
 
491 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281317  normal  0.630797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.99 
 
 
487 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.33 
 
 
491 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.06 
 
 
486 aa  180  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2270  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.68 
 
 
491 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  34.94 
 
 
470 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.68 
 
 
489 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  35.28 
 
 
527 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.12 
 
 
486 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.14 
 
 
483 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.83 
 
 
476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.21 
 
 
495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.21 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.55 
 
 
486 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.06 
 
 
486 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.53 
 
 
486 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.82 
 
 
485 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.67 
 
 
494 aa  169  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  34.43 
 
 
534 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.47 
 
 
489 aa  169  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.72 
 
 
479 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.14 
 
 
483 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.88 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.75 
 
 
492 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  35.09 
 
 
527 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.49 
 
 
485 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>