More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1048 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
174 aa  358  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  81.66 
 
 
179 aa  297  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  82.53 
 
 
167 aa  295  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  81.93 
 
 
167 aa  295  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  66.46 
 
 
264 aa  234  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.25 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  66.05 
 
 
182 aa  231  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  64.81 
 
 
182 aa  231  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  64.6 
 
 
271 aa  230  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  65.62 
 
 
216 aa  230  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  66.05 
 
 
199 aa  229  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  67.95 
 
 
184 aa  227  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.85 
 
 
181 aa  226  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 
183 aa  225  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  64.2 
 
 
183 aa  223  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  63.41 
 
 
185 aa  221  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.55 
 
 
183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.89 
 
 
180 aa  220  6e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.93 
 
 
179 aa  220  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  63.47 
 
 
226 aa  220  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  68.53 
 
 
179 aa  220  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  62.2 
 
 
183 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  62.2 
 
 
184 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  63.58 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.42 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.12 
 
 
183 aa  217  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  64.9 
 
 
178 aa  218  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.64 
 
 
183 aa  217  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  64 
 
 
213 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  60.61 
 
 
184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.37 
 
 
184 aa  213  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.24 
 
 
184 aa  213  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  62.18 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.24 
 
 
184 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
184 aa  207  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  54.04 
 
 
168 aa  206  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  62.67 
 
 
172 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.69 
 
 
170 aa  204  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
179 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
179 aa  204  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
179 aa  204  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
172 aa  203  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
172 aa  203  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
172 aa  203  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
172 aa  203  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
172 aa  203  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
172 aa  203  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
172 aa  203  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.41 
 
 
170 aa  203  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.05 
 
 
170 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.96 
 
 
170 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.8 
 
 
791 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  56.05 
 
 
170 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.89 
 
 
202 aa  201  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.79 
 
 
169 aa  201  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
170 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.96 
 
 
169 aa  200  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.36 
 
 
792 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.64 
 
 
183 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  58.13 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.54 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  51.74 
 
 
193 aa  198  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.17 
 
 
794 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
165 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.47 
 
 
794 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  59.03 
 
 
167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.59 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  61.22 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.97 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.59 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  53.12 
 
 
170 aa  195  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  58.22 
 
 
159 aa  195  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  58.9 
 
 
159 aa  195  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58.9 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  54.22 
 
 
268 aa  194  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  54.22 
 
 
268 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.88 
 
 
251 aa  194  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.66 
 
 
793 aa  194  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
167 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  56.76 
 
 
170 aa  193  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
167 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  55.42 
 
 
264 aa  193  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  57.96 
 
 
173 aa  193  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
167 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.71 
 
 
176 aa  192  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  58.06 
 
 
158 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  58.06 
 
 
158 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.93 
 
 
191 aa  192  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
158 aa  191  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
158 aa  191  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 
169 aa  191  5e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  55.62 
 
 
184 aa  191  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  58.9 
 
 
159 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>