118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1517 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1517  HemX protein, putative  100 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0952  cytochrome c assembly protein  64.71 
 
 		 281 aa  371  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1425  HemX protein, putative  60.66 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0895  cytochrome c assembly protein  61.03 
 
 		 293 aa  334  7.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.586988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1794  cytochrome c assembly protein  64.34 
 
 		 262 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1537  cytochrome c assembly protein  56.27 
 
 		 281 aa  281  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000307971  hitchhiker  0.00260082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0935  cytochrome c assembly protein  52.94 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.685136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.26 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  25.54 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  31.69 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  23.32 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.7 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  26.7 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  25.69 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  25.97 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  26.67 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  25.97 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  25.97 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  26.25 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.98 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.2 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  28.99 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0579  cytochrome c assembly protein  22.1 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.81 
 
 		 454 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.98 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  31.93 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  24.64 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  28.21 
 
 		 391 aa  53.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  24.88 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  27.34 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  24.68 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  27.5 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.16 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1235  hemX protein  27.42 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.299546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  24.17 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  23.81 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  25.27 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.13 
 
 		 405 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  20.97 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  27.4 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  30 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.54 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  25.63 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  26.58 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  26.06 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  29.09 
 
 		 407 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  26.67 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  29.41 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  24.32 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1729  cytochrome c assembly protein  23.39 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.622186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1763  cytochrome c assembly protein  23.39 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  28.18 
 
 		 381 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  25 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  30.17 
 
 		 444 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.38 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.27 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.27 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  26.83 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.27 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.27 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  27.03 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  29.09 
 
 		 379 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 396 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  25.81 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  26.61 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  25.83 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.48 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.21 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.27 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  22.66 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25.83 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.31 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  27.27 
 
 		 395 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  24.11 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  28.32 
 
 		 444 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3181  cytochrome c assembly protein  27.59 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.45 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.45 
 
 		 405 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.32 
 
 		 444 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  27.43 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1839  cytochrome c assembly protein  24.21 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4556  hemX protein  26.17 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4362  hemX protein  26.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4198  hemX protein  26.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4209  hemX protein  26.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4697  hemX protein  26.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  26.36 
 
 		 396 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  29.2 
 
 		 442 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4601  hemX protein  26.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4552  hemX protein  26.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.8 
 
 		 395 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  25.63 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  27.88 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.46 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  27.14 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0159  cytochrome c assembly protein  27.27 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>