More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8630 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  100 
 
 		 343 aa  678    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.14 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 400 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 426 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  33.25 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  32.67 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  36.16 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.61 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  30.87 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  32.41 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  34.95 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  31.61 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  34.32 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  36.55 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  37.7 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  34.5 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 469 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.33 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  32.92 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 378 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  38.6 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  31.32 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  33.25 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  37.55 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 435 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  37.17 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  31.91 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  31.42 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  35.56 
 
 		 483 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  37.89 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 515 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  30.95 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  30.95 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  30.95 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  37.5 
 
 		 472 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  30.95 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  36.77 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  33.97 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.37 
 
 		 467 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 450 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  36.77 
 
 		 460 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  36.65 
 
 		 483 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  31.13 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 459 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.49 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  29.12 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 462 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 493 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 487 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  32.91 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 504 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  30.43 
 
 		 527 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.07 
 
 		 486 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 517 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 505 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 475 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 505 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 444 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  33.07 
 
 		 429 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34.65 
 
 		 471 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  35.5 
 
 		 473 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  32.51 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  28.81 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 505 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 505 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  29.63 
 
 		 459 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 491 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 461 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 515 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.76 
 
 		 515 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  32.27 
 
 		 491 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  34.65 
 
 		 496 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>