More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8151 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 470 aa  971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  60.72 
 
 		 465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  61.36 
 
 		 465 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  60.89 
 
 		 467 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 466 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 471 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 471 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 481 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 524 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  44.19 
 
 		 588 aa  422  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 481 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 459 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 478 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>