More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7688 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  75.74 
 
 		 446 aa  712    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  71.06 
 
 		 440 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  72.07 
 
 		 434 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 445 aa  920    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  70.9 
 
 		 442 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  71.62 
 
 		 438 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.52 
 
 		 443 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  71.17 
 
 		 446 aa  651    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  72.64 
 
 		 431 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.21 
 
 		 449 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  68.82 
 
 		 441 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  69.23 
 
 		 451 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  71.33 
 
 		 446 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  71.33 
 
 		 446 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  71.33 
 
 		 446 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  69.2 
 
 		 440 aa  625  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  68.74 
 
 		 450 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  68.75 
 
 		 441 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  67.89 
 
 		 459 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  67.58 
 
 		 483 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  67.82 
 
 		 441 aa  611  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.37 
 
 		 444 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.32 
 
 		 426 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  69.77 
 
 		 445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.56 
 
 		 448 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  68.19 
 
 		 482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  67.51 
 
 		 457 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  67.66 
 
 		 446 aa  599  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  67.45 
 
 		 447 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  64.16 
 
 		 460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  68.85 
 
 		 426 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.74 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.51 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.16 
 
 		 411 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.64 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.55 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.04 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.16 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.91 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.19 
 
 		 414 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.63 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.98 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.47 
 
 		 390 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  44.42 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43 
 
 		 389 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43 
 
 		 389 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.3 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.54 
 
 		 396 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  42.52 
 
 		 417 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.49 
 
 		 390 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  42.99 
 
 		 417 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.55 
 
 		 396 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  42.52 
 
 		 417 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  42.52 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.75 
 
 		 390 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  42.52 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  41.82 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 		 396 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  45.32 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.31 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.31 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.91 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.3 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  41.82 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  42.26 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.23 
 
 		 404 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  42.03 
 
 		 475 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  41.86 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  41.86 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  43.96 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  44.2 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  42.72 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  44.8 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  44.33 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  43.72 
 
 		 396 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  42.93 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 		 417 aa  332  9e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  43.42 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  44.58 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  41.82 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  43.83 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  43.72 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.99 
 
 		 417 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.51 
 
 		 396 aa  329  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  39.72 
 
 		 417 aa  329  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.65 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  41.4 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  44.8 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  40.42 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>