More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7133 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7133  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
481 aa  946    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00959772  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.72 
 
 
517 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904468  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10810  oxidoreductase  56.42 
 
 
499 aa  524  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000610041  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2717  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.89 
 
 
472 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37510  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  55.18 
 
 
493 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102404  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0665  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.94 
 
 
488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4083  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57.42 
 
 
478 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931282  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  52.77 
 
 
474 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0813  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.54 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1337  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  50.1 
 
 
500 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5845  mercuric reductase, truncated  52.98 
 
 
470 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.499074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  54.97 
 
 
459 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3562  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.72 
 
 
482 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0113  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.41 
 
 
505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.03 
 
 
467 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0298342  normal  0.259477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4489  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  49.79 
 
 
480 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0937  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.57 
 
 
493 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486491  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1076  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  47.96 
 
 
509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.56 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.89 
 
 
448 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  35.93 
 
 
452 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.09 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0080326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.15 
 
 
451 aa  227  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201849  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.95 
 
 
458 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.9 
 
 
448 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2073  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.88 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.785339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2170  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.89 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.9 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.391833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.06 
 
 
462 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4442  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.7 
 
 
469 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 
585 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  30.54 
 
 
459 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  30.33 
 
 
466 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  41.64 
 
 
546 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.622847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.91 
 
 
546 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
453 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.65246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  31.93 
 
 
486 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.79 
 
 
465 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 
720 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  30.21 
 
 
507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  31.72 
 
 
467 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  27.62 
 
 
460 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  30.94 
 
 
516 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.16 
 
 
466 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.88 
 
 
481 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.3 
 
 
465 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.11 
 
 
472 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.95 
 
 
481 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.23 
 
 
484 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.87 
 
 
713 aa  170  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.49 
 
 
465 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.1 
 
 
477 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  31.24 
 
 
505 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  29.58 
 
 
460 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.64 
 
 
470 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.25 
 
 
448 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.5 
 
 
465 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  28.96 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  31.01 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  29.31 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.48 
 
 
482 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
484 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.81 
 
 
487 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  28.51 
 
 
716 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.97 
 
 
465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.56 
 
 
487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.05 
 
 
481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.21 
 
 
484 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  29.41 
 
 
459 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.21 
 
 
462 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 
487 aa  166  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  30.74 
 
 
722 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 
473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.65 
 
 
471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  29.05 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  29.5 
 
 
459 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  28.57 
 
 
738 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  28.04 
 
 
508 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  29.5 
 
 
590 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.18 
 
 
476 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  29.5 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.68 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  27.51 
 
 
713 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  28 
 
 
459 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  28.81 
 
 
457 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  29.2 
 
 
459 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  27.29 
 
 
458 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.95 
 
 
470 aa  163  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.53 
 
 
482 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  29.72 
 
 
458 aa  162  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  31.33 
 
 
459 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  27.12 
 
 
546 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.34 
 
 
479 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
464 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
480 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.82 
 
 
451 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.89 
 
 
491 aa  161  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  28.78 
 
 
459 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>