49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5875 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1069    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  44.16 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  45.07 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  39.52 
 
 		 1029 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  33.8 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  31.1 
 
 		 279 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.52 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.94 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  29.55 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 1332 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  32.65 
 
 		 253 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  30.29 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.97 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  31.46 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  31.97 
 
 		 243 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  28.4 
 
 		 566 aa  62  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.86 
 
 		 12684 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  33.65 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  34.52 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  32.16 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  31.48 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  32.8 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  32.8 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  32.8 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  34.5 
 
 		 276 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  27.71 
 
 		 580 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 669 aa  54.3  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  34.65 
 
 		 271 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  29.78 
 
 		 239 aa  53.5  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  28.97 
 
 		 259 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  30.39 
 
 		 283 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  33.49 
 
 		 275 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  30 
 
 		 870 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  30.33 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  33.58 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  30.68 
 
 		 770 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  24.75 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.98 
 
 		 834 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  23.84 
 
 		 885 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  32.26 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  28.91 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.69 
 
 		 1474 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 		 1050 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  24.23 
 
 		 324 aa  44.3  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  24 
 
 		 298 aa  43.5  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>