More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3811 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3811  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 396 aa  770    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333022  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2923  regulatory protein DeoR  48.72 
 
 		 362 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3563  regulatory protein DeoR  43 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21330  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149427  normal  0.181929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29000  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2682  regulatory protein DeoR  37.53 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191466  normal  0.937043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03440  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4061  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  34.65 
 
 		 361 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0623  regulatory protein DeoR  35.43 
 
 		 354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.369416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  38.16 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.98 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.44 
 
 		 333 aa  94  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1220  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.485348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  25.46 
 
 		 364 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  29.97 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  29.97 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  29.97 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  29.62 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.35 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.85 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  29.58 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  28.82 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  29.23 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  28.77 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  28.07 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  27.56 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  25.52 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  22.85 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.52 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  28.47 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  29.72 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1599  LacI family transcription regulator  21.67 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2305  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  28.72 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.62 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  28.42 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  24.91 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  27.34 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  24.03 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  27.68 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  25.6 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  27.18 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  25.34 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  25.34 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  27.05 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  27.97 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  27.02 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  25.34 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  25.34 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  25.34 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  30.88 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4738  alanine racemase  29.01 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  31.13 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  23.59 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0649  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.21 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.174613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  23.89 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  26.21 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  25.52 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  25 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  29.01 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.26 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2112  transcriptional regulator, LacI family  21.48 
 
 		 331 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  25.34 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  25.17 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  25.53 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  33.81 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  23.1 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  23.95 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  25.7 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>