175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3676 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3676  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  41.15 
 
 
233 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0925  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
211 aa  98.6  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  29.84 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  29.87 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  27.57 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  26.49 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  27.39 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  41.76 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 
190 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
190 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  26.6 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  25.32 
 
 
191 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  24.42 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  25.49 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  24.46 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  25.89 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  22.34 
 
 
211 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
182 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
186 aa  58.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
224 aa  58.5  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  23.44 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  35.35 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  24.22 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  35.51 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  25.17 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  27.27 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
179 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  23.27 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  25.83 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  25.25 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  25.38 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  27.4 
 
 
188 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  24.83 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  25.5 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  26.17 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  34.02 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  30.48 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  26.51 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
179 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  26.36 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  24.24 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  28.15 
 
 
186 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  23.98 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
179 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  35.79 
 
 
180 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  23.04 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  23.86 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2465  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
202 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  26.55 
 
 
217 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  27.82 
 
 
199 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  25.97 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  28.15 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  23.98 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  25 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  27.49 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>