More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1720 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.742638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5874  ABC-type maltose transport systems permease component-like protein  68.66 
 
 
274 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.59 
 
 
293 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.93 
 
 
295 aa  296  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
281 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.461733  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.94 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
297 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
296 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.785118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
280 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
280 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
299 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
316 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
280 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341564  decreased coverage  0.00499995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
280 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.09 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  34.02 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
282 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  30.08 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  30.08 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7335  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.2 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0398278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.65 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
292 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
293 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
293 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
326 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
299 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
299 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
289 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
278 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
297 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
276 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
282 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270449  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5253  ABC transporter membrane spanning protein (sugars)  35.35 
 
 
354 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
278 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.194848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
300 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.92 
 
 
305 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
279 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
352 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.142447  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.73 
 
 
275 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
279 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0806983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
285 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  30.4 
 
 
278 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
281 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
277 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
286 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
870 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17040  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.58 
 
 
299 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
277 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
298 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
285 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397277  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.31 
 
 
275 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  35.32 
 
 
298 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
271 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 
277 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 
271 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
271 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4881  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
269 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196924  normal  0.0342078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
271 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
285 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
297 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
283 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
307 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
279 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1347  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
347 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.113073  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
360 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0156579  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
296 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
277 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
301 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
278 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.698198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  30.5 
 
 
333 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  28.22 
 
 
278 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
289 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.83 
 
 
283 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04910  ABC-type sugar transport system, permease component  30.74 
 
 
277 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.649661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>