More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04910  ABC-type sugar transport system, permease component  100 
 
 
277 aa  551  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.649661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.79 
 
 
278 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.34 
 
 
314 aa  311  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
283 aa  275  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599669  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
270 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
296 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.500307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.08 
 
 
296 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.03 
 
 
302 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.45 
 
 
281 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.81 
 
 
277 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  32.85 
 
 
308 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
269 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
295 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  35.27 
 
 
278 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
298 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
268 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35 
 
 
279 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 
275 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  33.21 
 
 
278 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
298 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
287 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0110581  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
289 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
300 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  37.61 
 
 
290 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 
297 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
304 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0465217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
294 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3958  putative sugar transporter, permease protein  35.74 
 
 
300 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
270 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 
269 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.94 
 
 
305 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 
271 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
271 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
281 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
283 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
319 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  34.47 
 
 
276 aa  148  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.81 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
246 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
292 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
301 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107146  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
286 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
284 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
278 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
298 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
271 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
280 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
298 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  35.68 
 
 
278 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  35.68 
 
 
278 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
274 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
297 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
309 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
281 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302413  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06320  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.56 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12340  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspB  34.41 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
281 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5710  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.92 
 
 
280 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  36.02 
 
 
298 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
272 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  30.82 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.852647  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  33.57 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
743 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.445152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
273 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
273 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  30.43 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  30.43 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  30.43 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  30.43 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
310 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15080  ABC-type sugar transport system, permease component  31.91 
 
 
274 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
290 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
273 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  30.43 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1734  carbohydrate ABC transporter permease  33.09 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1529  carbohydrate ABC transporter permease  33.09 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
315 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
277 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 
273 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
274 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0262068  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  31.43 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>