More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1636 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1529  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1734  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519488 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.28 
 
 
273 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
279 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  32.71 
 
 
278 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
299 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 
278 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
280 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
301 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 
303 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
298 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
273 aa  156  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
285 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
294 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
270 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
270 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
280 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  30.74 
 
 
269 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  31.95 
 
 
275 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
301 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
276 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.59 
 
 
305 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  32.5 
 
 
278 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
293 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
284 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
296 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
284 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 
302 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  32.71 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.29 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
246 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
311 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  32.62 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  32.34 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32 
 
 
277 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
284 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
269 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
268 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
304 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0465217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
304 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
275 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
295 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
283 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
279 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0806983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
273 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  36.32 
 
 
290 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
294 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
278 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
304 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
271 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
282 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
309 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.58 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241092  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  31.39 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.86 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  31.7 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0183721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
283 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.88 
 
 
295 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
300 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 
701 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  30.48 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  28.68 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  37.5 
 
 
298 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
297 aa  138  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
722 aa  138  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
324 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
275 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
280 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.8 
 
 
305 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
281 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
315 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.45 
 
 
293 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
290 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  30.29 
 
 
272 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
272 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
314 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
298 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
292 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3392  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.55 
 
 
278 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196448  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 
277 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  29.67 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  31.06 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
312 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  32.84 
 
 
285 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
296 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.500307  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
310 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>