More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1169 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241092  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 
282 aa  225  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
302 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
271 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
271 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.67 
 
 
279 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  38.91 
 
 
277 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 
281 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.41 
 
 
277 aa  179  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
290 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
270 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
301 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 
269 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  33.57 
 
 
277 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.12 
 
 
271 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
271 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.4 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
273 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
295 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
324 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
284 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
290 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
315 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
299 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
268 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
297 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
301 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.82 
 
 
275 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
280 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.58 
 
 
304 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
275 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
295 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
301 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
303 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  36.4 
 
 
276 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
283 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
722 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
271 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.53 
 
 
278 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
294 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.78 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
283 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
272 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  32.33 
 
 
308 aa  152  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
296 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
291 aa  152  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.378357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1529  carbohydrate ABC transporter permease  32.39 
 
 
274 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1734  carbohydrate ABC transporter permease  32.39 
 
 
274 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
274 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  34.19 
 
 
278 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5330  ABC transporter  33.57 
 
 
274 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
246 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  30.88 
 
 
276 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  35.84 
 
 
701 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
275 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
271 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  35.38 
 
 
273 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
279 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
298 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.15 
 
 
295 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
273 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5004  sugar ABC transporter permease  36.98 
 
 
316 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0638088  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  34.72 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.09 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  35.84 
 
 
701 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  35.82 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  36.05 
 
 
287 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
307 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  36.82 
 
 
263 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
275 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
278 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
274 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
299 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
274 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
311 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
314 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.023503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  36.8 
 
 
699 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
297 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
307 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
307 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
281 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
292 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>