More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0946 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
273 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1529  carbohydrate ABC transporter permease  53.28 
 
 
274 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1734  carbohydrate ABC transporter permease  53.28 
 
 
274 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.28 
 
 
274 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
279 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
270 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
276 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
299 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  36.19 
 
 
277 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
284 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
280 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
285 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
274 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
289 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
269 aa  165  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  31.05 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
324 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
284 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
284 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  33.33 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
303 aa  162  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
273 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
271 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
280 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.67 
 
 
297 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
312 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
305 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
295 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
290 aa  158  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
277 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.78 
 
 
305 aa  158  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
299 aa  158  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.09 
 
 
302 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  32.53 
 
 
278 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  32.48 
 
 
276 aa  157  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.72 
 
 
278 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
295 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
311 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
282 aa  155  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
296 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  35.86 
 
 
276 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
278 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
274 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 
278 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
274 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  32.84 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
300 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
280 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
272 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  30.11 
 
 
272 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
285 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
294 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  33.58 
 
 
273 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
268 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
272 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0183721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.33 
 
 
279 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
290 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  38.25 
 
 
281 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  30.62 
 
 
277 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
294 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
272 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
300 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
297 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
278 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
278 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
279 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.73 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.26 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15080  ABC-type sugar transport system, permease component  30.37 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  30.51 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  32.34 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
275 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  28.21 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
315 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
299 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
292 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
308 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
293 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5330  ABC transporter  32.7 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  29.64 
 
 
290 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
315 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>