More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0630 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
352 aa  697    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.142447  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 
326 aa  388  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.15 
 
 
297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
360 aa  245  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0156579  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 
444 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0294771  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
268 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.642637 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
268 aa  172  9e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
268 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.27412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
280 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
280 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
279 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
279 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
280 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
282 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
282 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
277 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  33.22 
 
 
283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  33.22 
 
 
283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  30.91 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
275 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
280 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
275 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
289 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.38 
 
 
275 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
279 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
293 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
297 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
277 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
283 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
275 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135258  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
458 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360729  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
281 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.461733  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.57 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 
295 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
311 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
282 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  29.64 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
275 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
280 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  29.64 
 
 
293 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
306 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.76 
 
 
278 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
292 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  31.45 
 
 
296 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  31.45 
 
 
296 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
277 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
285 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
271 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
277 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
280 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
304 aa  105  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 
292 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 
275 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.95 
 
 
277 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2104  permease protein  31.22 
 
 
329 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.377288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
276 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  31.29 
 
 
296 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
870 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  31.29 
 
 
296 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
301 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
307 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  31.13 
 
 
296 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5253  ABC transporter membrane spanning protein (sugars)  36.46 
 
 
354 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  31.17 
 
 
296 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
294 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
297 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.917211  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
277 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
324 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
289 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
289 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
289 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
277 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
275 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0376  maltose transporter permease  31.17 
 
 
296 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.977537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3916  maltose transporter permease  31.17 
 
 
296 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.365338  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0304  maltose transporter permease  31.17 
 
 
296 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4272  maltose transporter permease  29.57 
 
 
296 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>