More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1057 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
293 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
293 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
280 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
280 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
281 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
316 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
292 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.1 
 
 
319 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
279 aa  165  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
279 aa  165  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.86 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.11 
 
 
278 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
870 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
296 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
289 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
300 aa  159  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  36.93 
 
 
280 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
282 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
281 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
280 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
297 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
296 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
280 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
277 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
280 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
306 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
277 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
307 aa  152  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
300 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
287 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
302 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
311 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
283 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
793 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
279 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
299 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
282 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
282 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  32.66 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
823 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
823 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  32.8 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  32.8 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
279 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
291 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  35.83 
 
 
296 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
291 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
275 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 
278 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
833 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
380 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
833 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
280 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595578 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
275 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4583  maltose transporter permease  37.5 
 
 
296 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
299 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03904  maltose transporter subunit  37.15 
 
 
296 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
296 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4494  maltose transporter permease  37.15 
 
 
296 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348431  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
278 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5513  maltose transporter permease  37.15 
 
 
296 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03864  hypothetical protein  37.15 
 
 
296 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3997  maltose transporter permease  37.15 
 
 
296 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0710551  normal  0.724914 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
278 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4272  maltose transporter permease  37.15 
 
 
296 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
283 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  40.17 
 
 
296 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  35.5 
 
 
296 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  35.5 
 
 
296 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
444 aa  142  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0294771  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
288 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.34 
 
 
275 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  35.33 
 
 
296 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  35.33 
 
 
296 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7335  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.84 
 
 
280 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0398278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
746 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.25 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  35.06 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>