More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0308 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
310 aa  600  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
404 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
404 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.1795  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
275 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.01 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
299 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
279 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
277 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
280 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
293 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
299 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
278 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
278 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.88 
 
 
280 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
280 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
280 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
253 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
293 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
280 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
289 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  41.88 
 
 
280 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1957  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
280 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.605299  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
280 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
282 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
280 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
289 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
276 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
306 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
283 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
296 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
291 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
291 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
283 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
299 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.63 
 
 
280 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 
295 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
286 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.17 
 
 
277 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
281 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
277 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.46 
 
 
297 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
311 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
290 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
307 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
277 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
275 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
296 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.97 
 
 
289 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
288 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
275 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
277 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
281 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
276 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0519592  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 
280 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
277 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  31.33 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
322 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
279 aa  139  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
275 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
288 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  30.39 
 
 
275 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  33.21 
 
 
280 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
292 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
284 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
283 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
277 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
275 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
285 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.547781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83959  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6239  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  36.47 
 
 
286 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
277 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
295 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
275 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
296 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
278 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.03 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>