62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0596 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  41.66 
 
 
1216 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  100 
 
 
1130 aa  2241    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  45.73 
 
 
1127 aa  823    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  39.17 
 
 
1104 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  38.85 
 
 
1099 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  39.26 
 
 
1116 aa  563  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  39.26 
 
 
1314 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  38.54 
 
 
1083 aa  519  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  37.33 
 
 
1125 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.88 
 
 
1086 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  36.9 
 
 
1264 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  37.39 
 
 
1264 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  37.1 
 
 
1264 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  37.27 
 
 
1264 aa  485  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  36.65 
 
 
1086 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  37.13 
 
 
1262 aa  482  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  37.97 
 
 
1012 aa  472  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  36.9 
 
 
1422 aa  459  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  45.53 
 
 
1001 aa  439  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  36.01 
 
 
1055 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  34.43 
 
 
988 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  36.88 
 
 
963 aa  376  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  39.16 
 
 
1329 aa  373  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  39.56 
 
 
1297 aa  337  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  39.73 
 
 
1178 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  34.64 
 
 
1210 aa  328  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  34.64 
 
 
1210 aa  328  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  38.45 
 
 
1291 aa  325  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  34.95 
 
 
1210 aa  323  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.42 
 
 
1220 aa  322  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  35.24 
 
 
1210 aa  321  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.06 
 
 
1210 aa  319  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  35.06 
 
 
1209 aa  315  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  30.13 
 
 
1139 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  29.26 
 
 
1139 aa  170  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  29.26 
 
 
1139 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  29.31 
 
 
971 aa  169  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.43 
 
 
1139 aa  168  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  28.99 
 
 
1137 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.91 
 
 
1146 aa  164  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.56 
 
 
1108 aa  161  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.22 
 
 
1275 aa  142  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  26.42 
 
 
1249 aa  126  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  26.38 
 
 
465 aa  112  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.88 
 
 
903 aa  102  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  22.83 
 
 
857 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  22.86 
 
 
898 aa  96.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  25.58 
 
 
1094 aa  94  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  19.95 
 
 
789 aa  91.7  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  23.63 
 
 
754 aa  89.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  22.84 
 
 
762 aa  84.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  18.79 
 
 
800 aa  82  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  21.66 
 
 
774 aa  81.6  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  28.48 
 
 
817 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  23.71 
 
 
634 aa  71.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.4 
 
 
837 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  20.8 
 
 
862 aa  67.8  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  29.13 
 
 
811 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  24.07 
 
 
739 aa  61.6  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  20.82 
 
 
862 aa  59.7  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  23.08 
 
 
852 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  23.51 
 
 
670 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>