More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4867 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  100 
 
 		 473 aa  981    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  45.99 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  43.81 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  46.15 
 
 		 476 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  45.92 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  45.37 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  44.71 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  47.1 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  45.58 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  44.72 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  44.05 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  44.8 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  44.22 
 
 		 457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  40.92 
 
 		 480 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  45.58 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  42.67 
 
 		 506 aa  352  7e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  43.84 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  43.36 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  46.27 
 
 		 569 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  41.02 
 
 		 468 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  44.67 
 
 		 473 aa  319  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  42.04 
 
 		 481 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  37.32 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  36.99 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  36.75 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  36.99 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  37.38 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  36.99 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  36.75 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  36.75 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  36.75 
 
 		 453 aa  276  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.25 
 
 		 454 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  36.91 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  36.5 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  36.12 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  40.11 
 
 		 570 aa  243  7.999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  33.25 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  41.22 
 
 		 579 aa  213  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.58 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.77 
 
 		 494 aa  182  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  32.35 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  32.25 
 
 		 465 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  28.86 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  28.77 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  31.06 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  27.53 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.43 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  28.57 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  28.1 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  28.1 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  28.79 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  29.04 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  27.54 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  29.22 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  29.04 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  31.99 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.17 
 
 		 424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  27.18 
 
 		 405 aa  157  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  27.9 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.05 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  29.61 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  27.04 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  27.74 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  27.15 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  27.53 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.92 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  30.43 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  28.34 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  28.34 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  28.34 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  30.13 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  29.72 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  30.13 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  28.34 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.95 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  28.34 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  25.99 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  30.19 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  27.86 
 
 		 453 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  28.1 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  28.1 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  27.65 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  27.53 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.35 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  28.1 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.78 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  27.82 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  27.79 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  29.95 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  30.38 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  29.87 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  27.87 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  29.97 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  27.58 
 
 		 446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  27.36 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  29.16 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>