36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4574 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  100 
 
 		 403 aa  820    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 441 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  33.5 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  29.69 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  33.67 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  31.84 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 397 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  32.35 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  23.45 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  23.17 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  25.49 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  32.93 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  26.49 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 		 2240 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 3172 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.73 
 
 		 602 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.54 
 
 		 681 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  19.54 
 
 		 979 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  23.93 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 3035 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 3301 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>