31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3994 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 930 aa  909    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  100 
 
 		 967 aa  1953    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  39.55 
 
 		 944 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 946 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 935 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  35.84 
 
 		 507 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  42.36 
 
 		 446 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  31.83 
 
 		 526 aa  204  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  34.68 
 
 		 529 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  34.9 
 
 		 473 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  32.73 
 
 		 525 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  35.98 
 
 		 433 aa  187  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  36.21 
 
 		 499 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  31.65 
 
 		 533 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  36.34 
 
 		 390 aa  182  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 		 564 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  37.29 
 
 		 554 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  38.94 
 
 		 464 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  31 
 
 		 490 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  39.33 
 
 		 392 aa  168  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  36.34 
 
 		 449 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  37.58 
 
 		 464 aa  163  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32 
 
 		 561 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.87 
 
 		 561 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  32.12 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  31.9 
 
 		 432 aa  118  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  31.61 
 
 		 429 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  30.07 
 
 		 430 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  27.73 
 
 		 386 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  39 
 
 		 379 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  30.64 
 
 		 445 aa  44.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>