271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3655 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  100 
 
 		 536 aa  1106    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  57.01 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  59.57 
 
 		 560 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  59.5 
 
 		 565 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  58.61 
 
 		 526 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  59.38 
 
 		 556 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  58.4 
 
 		 534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  57.68 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  57.44 
 
 		 541 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  58.08 
 
 		 534 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  57.12 
 
 		 523 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  57.03 
 
 		 536 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  55.56 
 
 		 527 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  56.63 
 
 		 502 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  55.14 
 
 		 534 aa  552  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  56.51 
 
 		 485 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  56.92 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  57.49 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  57.58 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  57.26 
 
 		 484 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  56.66 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  55.62 
 
 		 490 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  56.14 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  57.2 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  56.46 
 
 		 484 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  54.2 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  55.8 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  55.95 
 
 		 487 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  55.45 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  56.35 
 
 		 484 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  55.03 
 
 		 490 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  56.94 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  57.57 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  55.86 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  56.43 
 
 		 481 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  56.43 
 
 		 495 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  56.46 
 
 		 486 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  56.55 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  55.18 
 
 		 484 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  54.17 
 
 		 500 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  54.91 
 
 		 486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  55.6 
 
 		 498 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  56.43 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  53.37 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  55.07 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  55.07 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  53.77 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  54.87 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  54.87 
 
 		 585 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  57.34 
 
 		 488 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  54.87 
 
 		 523 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  52.68 
 
 		 495 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  54.87 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  54.87 
 
 		 529 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  55 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  54.22 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  54.74 
 
 		 500 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  54.91 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  55.27 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  55.49 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  55.49 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  52.88 
 
 		 500 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  54.47 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  52.17 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  51.37 
 
 		 500 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  51.4 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  55.79 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.04 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 486 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  43.71 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  44.44 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  42.24 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  42.77 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  39.73 
 
 		 772 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  45.01 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  41.12 
 
 		 797 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  41.52 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.04 
 
 		 776 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  42.4 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  44.93 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  42.68 
 
 		 532 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 518 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  39.53 
 
 		 787 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  41.34 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  40.15 
 
 		 507 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  41.65 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  41.38 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  40.69 
 
 		 480 aa  359  7e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.3 
 
 		 513 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.99 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  44.38 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  41.5 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  39.84 
 
 		 505 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  41.39 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  43.74 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 492 aa  356  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  37.76 
 
 		 514 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>